博士在读 承接分子动力学模拟

不限于物理、化学、材料科学和生物医药等领域。
1.结构建模：构建分子或材料的三维结构模型。
2.吸附能、结合能、缺陷形成能：计算分子或原子间的相互作用能。
3.溶解电势：研究分子在溶液中的电化学性质。
4.态密度、能带结构、差分电荷：分析电子结构特性。
5.HOMO/LUMO、Mulliken电荷、静电势、fukui函数：研究分子的电子性质。
6.Gibbs自由能、活化能、反应能：计算化学反应的热力学和动力学参数。
模拟软件和技术
1.Gromacs：用于大分子动力学模拟。
2.LammPS：用于大规模原子/分子并行模拟。
3.Amber：用于生物分子模拟。
4.Autodock：用于分子对接研究。
5.MS.DS, Desmond：用于药物设计和分子模拟。
6.AlphaFold, RosettaFold：用于蛋白质结构预测。
研究方向和应用不限于：
1.生物体系：研究蛋白质、核酸等生物大分子的结构和功能。
2.医药和药物设计：预测药物分子与靶标蛋白的相互作用。
3.材料科学：研究材料的力学、热学和电学性质。
4.环境科学：研究分子在环境中的行为和影响。
实验对比和数据分析
分子动力学模拟计算不仅可以预测分子和材料的性质，还可以与实验数据进行对比，验证理论模型的准确性。数据分析方法包括：
1.热导率、粘度、比热以及动能势能的计算。
2.径向分布函数、自扩散系数、配位数、回转半径、角分布函数的分析。
3.应力-应变曲线、摩擦性质等力学性质的研究。
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