麦克雷

标题: PCR跑不出来的原因是什么?大概率是...... [打印本页]

作者: j30576851    时间: 前天 14:20
标题: PCR跑不出来的原因是什么?大概率是......
1 什么是PCR?
PCR(聚合酶链式反应)是一种分子生物学中用于快速复制大量特定DNA片段的技术。它由Kary Mullis在1983年发明,因此他获得了1993年的诺贝尔化学奖。PCR的基本步骤包括三个主要阶段:变性、退火和延伸,这些步骤在一个循环过程中重复进行,以指数方式增加目标DNA的数量。
1 变性(Denaturation):在这个阶段,双链DNA被加热至高温(通常是94°C至98°C),导致氢键断裂,使得DNA双链分离成两条单链。2 退火(Annealing):随后,温度降低至50°C至65°C,这时短的合成寡核苷酸引物(primers)可以与目标DNA的特定区域结合。这些引物是预先设计的,它们与目标DNA片段的两端互补。3 延伸(Extension):最后,温度再次升高至72°C,这时DNA聚合酶开始工作,沿着DNA单链合成新的互补链。由于聚合酶只能从5'到3'方向合成,所以每个新链的合成都需要一个引物。4 PCR的循环次数(cycle number)可以根据所需的DNA量来设定。通常,一个典型的PCR反应可以进行25到35个循环,每个循环都能将目标DNA的数量翻倍,理论上可以在几个小时内从单个DNA分子扩增到数十亿个分子。2 什么是引物?在PCR(聚合酶链式反应)实验中,引物(Primers)是短的、合成的单链DNA片段,它们在DNA扩增过程中扮演着至关重要的角色。引物的主要功能是为DNA聚合酶提供起始点,以确保只有目标DNA序列被精确地复制。往期引物设计方面的文章,Primer Premier5如何设计引物? 详细教程来了,引物设计 Primer Premier5操作详细过程-干货分享 分分钟学会引物设计原则:1、引物长度一般在15-30碱基之间2、GC含量在40%-60%之间,扩增的片段最好也是GC含量在40%-60%之间,这样比较容易扩增;引物Tm值范围为55-65℃,上下游引物Tm值不宜相差太大,最好不要超过5度。3、引物3′端不能选择A,最好选择T4、 碱基要随机分布,尤其3′端不应超过3个连续的G或C5、引物自身及引物之间不应存在互补序列,以防形成发夹结构(Hairpin)3 为什么跑不出来的原因详解?     PCR实验失败可能由多种因素导致,以下是一些常见原因的概述:1 DNA模板的质量问题:DNA降解:不当的冻融操作、非洁净的操作环境、DNA存储不当等都可能导致DNA降解。DNA纯度和浓度:不纯的DNA或DNA浓度过低都可能影响PCR扩增。2 引物设计不当:物种特异性:不同物种间的基因序列差异可能导致引物无法有效结合。设计错误:未遵循引物设计原则,如引物二聚体和发夹结构的形成。引物处理:错误的稀释或存储方法可能导致引物活性降低。3  Taq酶的选择和处理:酶活性:使用低保真度的Taq酶或多次冻融导致酶失活。酶种类:针对特定基因,可能需要高保真度的Taq酶。4  PCR仪器的性能:温度控制:仪器温度控制不准确可能导致DNA解链或延伸不充分。5 循环数设置:循环次数:对于低表达基因,可能需要增加循环数以获得足够的扩增。6  其他操作和环境因素:人为操作错误:未遵循实验操作规程,导致DNA模板、引物、试剂等出现质量问题。实验环境:实验室空气污染可能导致阴性对照出现阳性结果。




欢迎光临 麦克雷 (https://mavom.cn/) Powered by Discuz! X3.5